I sussidi per pubblicazione del FNS permettono la pubblicazione di lavori di alto valore scientifico (tra cui tesi di dottorato o di abilitazione), relativi a qualsiasi campo del sapere scientifico e che altrimenti non potrebbero essere portati a conoscenza del grande pubblico a causa dei costi eccessivi e del mercato troppo ristretto.

Regole generali
Sono sostenute tutte le opere scientifiche di alto valore la cui pubblicazione sarebbe impossibile altrimenti. Per le tesi di dottorato di regola vengono prese in considerazione solo tesi che hanno ricevuto il massimo dei voti.
Sono escluse pubblicazioni giubilari, riedizioni, traduzioni in lingua corrente e opere destinate a bibliofili.
Il richiedente del sussidio è responsabile di trovare una casa editrice e di negoziare con essa le condizioni contrattuali; il FNSR accorda un sussidio a fondo perso che serve a ridurre il prezzo di copertina del volume in modo da renderlo accessibile ad una cerchia più vasta. Nel caso di tesi di dottorato è richiesto comunque un contributo finanziario da parte dell'autore.
L'ammontare del sussidio si situa nella maggior parte dei casi fra i 5 ed i 15'000.-, ma con singoli montanti molto più elevati.

Presentazione della domanda
La domanda deve essere presentata sui formulari ufficiali allegando:
- il testo definitivo dell'opera (non necessariamente nell'impaginazione finale);
- il calcolo dei costi dell'editore;
- una bozza del contratto con l'editore;
- per le tesi di dottorato l'attestazione dell'università che la procedura è terminata.